Chemotion ELN
Weitere Informationen zur Auswahl eines ELN finden Sie im Artikel Choose the right ELN und zum Testen von Demo-Instanzen hier.
Möchten Sie gleich loslegen? Schauen Sie sich den Abschnitt Erste Schritte an!
Chemotion ELN wurde speziell für Chemiker entwickelt und berücksichtigt die besonderen Anforderungen der chemischen Laborarbeit und Dokumentation. Es dient als leistungsfähiges Digitalisierungswerkzeug für die Chemie, das darauf abzielt, nahtlose Arbeitsabläufe über den gesamten Lebenszyklus der Forschungsdaten zu schaffen. Die Verwirklichung dieser Vision ist eine gemeinschaftliche Anstrengung, die eine kontinuierliche Entwicklung, Verbesserung und Erweiterung des ELN erfordert.
Um sich einen Überblick zu verschaffen, wie und mit welchen Werkzeugen Chemotion ELN Sie im gesamten Datenlebenszyklus unterstützt, schauen Sie sich die folgenden Abschnitte an und informieren Sie sich über die einzelnen Schritte, indem Sie auf den Link im jeweiligen Abschnitt klicken.
Unterstützung des Datenlebenszyklus
Experiment-Design
Chemotion hilft bei der Planung von Experimenten und der Forschung, indem es eingebettete Struktur-Editoren anbietet, chemische Identifikatoren liest und generiert und Informationen aus relevanten Datenbanken abruft.
Experiment
Während der Experimente unterstützt Chemotion die Forscher mit automatisierten Berechnungen, strukturierter Dokumentation und einem kompakten Überblick über die experimentellen Informationen.
Datenerhebung und -verarbeitung
Für nahtlose Arbeitsabläufe können analytische Geräte angeschlossen und direkt aus dem Chemotion ELN heraus angesprochen werden. Neben dieser Verbindung können Daten von diesen Geräten automatisch übertragen werden, Dateiformate werden konvertiert und Metadaten werden zugeordnet.
Analyse
Analysen können direkt im Chemotion ELN durchgeführt werden, indem man einen der eingebetteten Spektren-Editoren verwendet.
Datenpublikation
Das Chemotion ELN ist mit mehreren Daten-Repositories verbunden. Integrierte Publishing-Workflows ermöglichen eine einfache und schnelle Veröffentlichung von Forschungsdaten.
Wiederverwendung von Daten
Chemotion ELN ermöglicht die einfache gemeinsame Nutzung von Daten und Einträgen mit anderen Mitarbeitern. Außerdem können sowohl Ihre eigenen Daten als auch die der Gruppenmitglieder für neue Experimente wiederverwendet werden.
LabIMotion
Neben seinem primären Schwerpunkt in der Chemie wird das ELN aufgrund seiner vielseitigen Funktionalität, die auf die Bedürfnisse von Wissenschaftlern in interdisziplinären Umgebungen zugeschnitten ist, auch in verschiedenen anderen Disziplinen eingesetzt. Diese generischen Elemente werden ständig weiterentwickelt und angepasst. Die jüngste Erweiterung, die im November 2023 eingeführt wurde, ist LabIMotion, die es den Nutzern ermöglicht, durch die Entwicklung neuer Module vollständig nicht-chemische Funktionalitäten einzubinden.
Chemotion Einführungsvideo
Eine kurze Einführung in das Chemotion ELN sowie die Anbindung an das Chemotion Repository wird in diesem Video gezeigt:
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Dokumentation, Informationen und Kontakt
Chemotion ELN und seine Funktionalitäten sind in verschiedenen Publikationen beschrieben (siehe unten). Für Benutzer, Entwickler und Administratoren ist eine Dokumentation auf der Website des Projekts verfügbar. Chemotion ELN ist eine Open-Source-Entwicklung; der Quellcode ist auf GitHub verfügbar.
Chemotion ist die ELN-Referenzinstanz in NFDI4Chem. Die Software wird von mehreren Entwicklern an verschiedenen NFDI4Chem-Standorten entwickelt. Die Entwicklung begann am Karlsruher Institut für Technologie (KIT) im Rahmen eines von der DFG geförderten Projekts. Die Erweiterung der Software wurde und wird weiterhin unterstützt durch das Ministerium für Wissenschaft, Forschung und Kunst Baden-Württemberg, das Karlsruher Institut für Technologie und die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG).
NFDI4Chem bietet praktische Workshops und Q&A-Sitzungen für Chemotion ELN und die LabIMotion-Erweiterung an. Besuchen Sie die Workshop-Übersichtsseite für weitere Informationen.
Erste Schritte
Neueinsteiger
Für Neueinsteiger gibt es verschiedene Möglichkeiten, mit Chemotion zu beginnen und die Software kennen zu lernen:
- Schauen Sie sich die Chemotion Docs an: Anleitungen sowohl im Chemotion ELN als auch im Chemotion Repo
- Schauen Sie sich die offizielle Chemotion Demo-Instanz an.
- Sehen Sie sich die Chemotion Tutorial Videos an: Machen Sie sich mit der Benutzeroberfläche und den Funktionen vertraut
- Nehmen Sie an einer Online-Live-Demo + Frage-Antwort-Runde teil
- Teilnahme an einem Chemotion ELN Hands-on Workshop
- Melden Sie sich bei der Chemotion-Mailingliste für Benutzer und Administratoren an, um auf dem Laufenden zu bleiben
Einführung von Chemotion ELN in Ihrer Gruppe
- Bevor Sie Chemotion ELN in Ihrer Forschungsgruppe einführen, sollten Sie eine Richtlinie für die gemeinsame Nutzung festlegen. Siehe Sharing is Caring: Guidelines for Sharing in the Electronic Laboratory Notebook (ELN) Chemotion as applied by a Synthesis-oriented Working Group als Anleitung.
- Installieren Sie ChemConverter-Profile für alle Dateitypen, die konvertiert werden müssen.
- Einrichtung interner Prozesse für die Datenveröffentlichung, wie z. B. Genehmigungsworkflows für Gruppenleiter. Siehe auch den Workflow für die Veröffentlichung im Chemotion Repo.
- Vermitteln Sie neuen Gruppenmitgliedern während des Einführungsprozesses die oben genannten Richtlinien und Arbeitsabläufe klar und deutlich.
- Legen Sie klare Richtlinien und Arbeitsabläufe für das Offboarding fest, um sicherzustellen, dass die erforderlichen Maßnahmen zur Aufhebung des Zugriffs ergriffen werden und andere Mitglieder der Gruppe bei Bedarf weiterhin Zugriff haben.
- Richten Sie Ihr chemisches Inventar für Ihre Gruppe ein und stellen Sie den korrekten Zugang dazu sicher. Sie können auch Chemikalienlisten importieren und exportieren.
- Richten Sie LabIMotion-Vorlagen ein, um das ELN zu erweitern und an Ihre Bedürfnisse anzupassen. Sie können auch einen LabIMotion Online Hands-on Workshop besuchen, um sich mit dieser Funktion vertraut zu machen.
Publikationen, Quellen und weitere Informationen
- Chemotion ELN: an Open Source electronic lab notebook for chemists in academia
- Chemotion-ELN part 2: adaption of an embedded Ketcher editor to advanced research applications
- CHEMSCANNER: extraction and re-use(ability) of chemical information from common scientific documents containing ChemDraw files
- Chemotion ELN-Dokumentation
- Chemotion ELN auf Github