Chemotion ELN
Um mehr über die Auswahl eines ELN zu erfahren, lesen Sie den Artikel „Das richtige ELN auswählen“ auf und testen Sie die Demo-Instanzen hier.
Möchtest du gleich loslegen? Schau dir den Abschnitt Erste Schritte an!
Das Chemotion ELN wurde speziell für Chemiker entwickelt und berücksichtigt dabei die besonderen Anforderungen der chemischen Laborarbeit und der Dokumentation. Es dient als leistungsstarkes Digitalisierungswerkzeug für die Chemie und zielt darauf ab, nahtlose Arbeitsabläufe über den gesamten Lebenszyklus von Forschungsdaten hinweg zu schaffen. Die Verwirklichung dieser Vision ist eine gemeinsame Aufgabe, die die kontinuierliche Weiterentwicklung, Verbesserung und Erweiterung des ELN erfordert.
Um einen Überblick darüber zu erhalten, wie und mit welchen Tools Chemotion ELN Sie während des gesamten Lebenszyklus von Forschungsdaten unterstützt, werfen Sie einen Blick auf die folgenden Abschnitte und erfahren Sie mehr über die einzelnen Schritte, indem Sie auf den Link im jeweiligen Abschnitt klicken.
Unterstützung des Datenlebenszyklus
Versuchsaufbau
Chemotion unterstützt die Versuchsplanung und Forschungsvorbereitung durch integrierte Struktur-Editoren, das Einlesen und Generieren von chemischen Bezeichnern sowie das Abrufen von Informationen aus relevanten Datenbanken.
Experiment
Bei Experimenten unterstützt Chemotion Forscher durch automatisierte Berechnungen, strukturierte Dokumentation und einen übersichtlichen Überblick über die Versuchsdaten.
Datenerhebung und -verarbeitung
Für nahtlose Arbeitsabläufe können Analysegeräte angeschlossen und direkt über das Chemotion-ELN aufgerufen werden. Neben dieser Verbindung können Daten von diesen Geräten automatisch übertragen, Dateiformate konvertiert und Metadaten zugeordnet werden.
Analyse
Analysen können direkt im Chemotion ELN durchgeführt werden, indem einer der integrierten Spektren-Editoren verwendet wird.
Veröffentlichung von Daten
Das Chemotion ELN ist mit mehreren Datenrepositorien verbunden. Integrierte Publikationsworkflows ermöglichen eine einfache und schnelle Veröffentlichung von Forschungsdaten.
Wiederverwendung von Daten
Chemotion ELN ermöglicht den einfachen Austausch von Daten und Einträgen mit Kooperationspartnern. Zudem können sowohl Ihre eigenen Daten als auch die der Gruppenmitglieder für neue Experimente wiederverwendet werden.
LabIMotion
Neben seinem Schwerpunkt in der Chemie wird das ELN aufgrund seiner vielseitigen Funktionalität, die den Anforderungen von Wissenschaftlern in interdisziplinären Umgebungen gerecht wird, auch in verschiedenen anderen Disziplinen eingesetzt. Diese allgemeinen Elemente werden ständig weiterentwickelt und angepasst. Die neueste Erweiterung, die im November 2023 eingeführt wurde, ist LabIMotion, mit der Nutzer durch die Entwicklung neuer Module vollständig chemiefreie Funktionen integrieren können.
Chemotion – Einführungsvideo
In diesem Video wird eine kurze Einführung in das Chemotion-ELN sowie die Verbindung zum Chemotion-Repository gezeigt:
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Dokumentation, Informationen und Kontakt
Chemotion ELN und seine Funktionen werden in verschiedenen Veröffentlichungen beschrieben (siehe unten). Für Nutzer, Entwickler und Administratoren steht eine Dokumentation auf der Website des Projekts zur Verfügung. Chemotion ELN ist ein Open-Source-Projekt; der Quellcode ist auf GitHub verfügbar.
Chemotion ist die ELN-Referenzinstanz in NFDI4Chem. Die Software wird von mehreren Entwicklern an verschiedenen NFDI4Chem-Standorten entwickelt. Die Entwicklung begann am Technischen Universität Karlsruhe (KIT) im Rahmen eines von der DFG geförderten Projekts. Die Weiterentwicklung der Software wurde und wird weiterhin vom Ministerium für Wissenschaft, Forschung und Kunst des Landes Baden-Württemberg, dem Karlsruher Institut für Technologie und der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) gefördert.
NFDI4Chem bietet praxisorientierte Workshops und Frage-und-Antwort-Runden zu Chemotion ELN und der Erweiterung LabIMotion an. Weitere Informationen finden Sie auf der Übersichtsseite zum Workshop.
Chemotion ELN ist aktives Mitglied des ELN-Konsortiums, einer Kooperationsgemeinschaft, die sich für die Entwicklung gemeinsamer Spezifikationen für ELNs einsetzt und das ELN-Dateiformat vorgelegt hat.
Erste Schritte
Neulinge
Es gibt verschiedene Möglichkeiten für Einsteiger, mit Chemotion zu beginnen und sich mit der Software vertraut zu machen:
- Schauen Sie sich die Chemotion-Dokumentation an: Dort finden Sie Anleitungen sowohl zum Chemotion-ELN als auch zum Chemotion-Repo.
- Schauen Sie sich die offizielle Chemotion-Demo-Instanz an.
- Schauen Sie sich die Chemotion-Tutorial-Videos an: Machen Sie sich mit der Benutzeroberfläche und den Funktionen vertraut.
- Nehmen Sie an einer Online-Live-Demo und Fragerunde teil
- Nehmen Sie an einem Chemotion ELN-Praxisworkshop teil
- Tragen Sie sich in die chemotion-Mailingliste für Nutzer und Administratoren ein, um auf dem Laufenden zu bleiben
Einführung von Chemotion ELN in Ihrem Konzern
- Bevor Sie mit der Einführung von Chemotion ELN in Ihrer Forschungsgruppe beginnen, legen Sie bitte Richtlinien für die gemeinsame Nutzung fest. Weitere Hinweise finden Sie unter „Sharing is Caring: Leitlinien für den Austausch im elektronischen Laborjournal (ELN) Chemotion, wie sie von einer synteseorientierten Arbeitsgruppe angewendet werden“.
- Installieren Sie ChemConverter-Profile für alle Dateitypen, die konvertiert werden müssen.
- Richten Sie interne Prozesse für die Veröffentlichung von Daten ein, wie beispielsweise Genehmigungsworkflows für Gruppenleiter. Siehe auch den Workflow für die Veröffentlichung im Chemotion-Repo.
- Vermitteln Sie neuen Gruppenmitgliedern während des Einarbeitungsprozesses die oben genannten Richtlinien und Arbeitsabläufe auf klare Weise.
- Legen Sie klare Richtlinien und Arbeitsabläufe für das Offboarding fest, um sicherzustellen, dass die erforderlichen Maßnahmen zur Entziehung von Zugriffsrechten ergriffen werden und dass andere Mitglieder der Gruppe bei Bedarf weiterhin Zugriff behalten.
- Richten Sie den Chemikalienbestand Inventar für Ihre Gruppe ein und stellen Sie sicher, dass der Zugriff darauf korrekt eingerichtet ist. Sie können auch Chemikalienlisten importieren und exportieren.
- Richten Sie die LabIMotion-Vorlagen ein, um das ELN zu erweitern und an Ihre Bedürfnisse anzupassen. Sie können auch an einem LabIMotion Online-Praxisworkshop teilnehmen, um sich mit dieser Funktion vertraut zu machen.
Veröffentlichungen, Quellen und weitere Informationen
- Chemotion ELN: Ein Open-Source-elektronisches Labor-Notizbuch für Chemiker im akademischen Bereich
- Chemotion-ELN Teil 2: Anpassung eines eingebetteten Ketcher-Editors an anspruchsvolle Forschungsanwendungen
- CHEMSCANNER: Extraktion und Wiederverwendbarkeit chemischer Informationen aus gängigen wissenschaftlichen Dokumenten, die ChemDraw-Dateien enthalten
- Chemotion ELN-Dokumentation
- Chemotion ELN auf GitHub